一场全球性的大灾难使得人类几乎灭绝。艾诺亚与汉娜两人虽然侥幸存活却难逃被追捕的命运。在这个看似绝望的世界里，今后他们该何去何从？想有良好的行为；想做正当的事！小时候，大家都是这么想的。当察觉到的时候，...

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一场全球性的大灾难使得人类几乎灭绝。艾诺亚与汉娜两人虽然侥幸存活却难逃被追捕的命运。在这个看似绝望的世界里，今后他们该何去何从？想有良好的行为；想做正当的事！小时候，大家都是这么想的。当察觉到的时候，却发现自己总是在做著坏事。为了让自己变强、为了想要救妹妹的艾力亚接受训练……。？为了希望能让全世界知道这块土地上的人权受到压制，过著贫苦的生活。玛莉含将受到迫害的画面利用通讯卫星转播至全世界。但是没想到对方竟派变形机器人杀尽所有的人…！玛莉含突然打来一通电话来告知健治说有恐怖份子准备进行爆破，也才得知玛莉含背叛同伴是为了阻止恐怖行动连续发生……！当健治好不容易借由电话得知玛莉含的所在位置，但没想到已有人设下陷阱……！埋葬了海雷娜之后，艾力亚便带著人造人雷提娜搭机准备前往澳洲雪梨。但是，他们所搭乘的飞机，却遭军机的飞弹击中爆炸。另一方面，三岛惠人一行人为了找出结晶化后的艾尔斯岩是否还有生还者，并采撷样本，于是便穿著防护衣，冒著生命危险潜入了艾尔斯岩的结晶领域。为了查出理查德‧爱鲁德利奇与威鲁海鲁姆公司之间的关系，玛克被派去寻找拉里‧爱巴森以及帕得力克‧钮恩两人…。另一方面，艾力亚带著雷提娜搭