现代日本的高中生“砂冢茂”跟他的同学“风间明夫”一起去了只限风间家的一家之主才能去的圣域，圣域里有三座围成三角形的鸟居，当到了某个季节特定的时间时，就会产生一股神秘的力量，将人卷入时空之中，回到了日本...

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现代日本的高中生“砂冢茂”跟他的同学“风间明夫”一起去了只限风间家的一家之主才能去的圣域，圣域里有三座围成三角形的鸟居，当到了某个季节特定的时间时，就会产生一股神秘的力量，将人卷入时空之中，回到了日本的战国时代。他们两人回到了庆长八年(公元1603年)，被卷入“风魔”和“伊贺”忍者之间的战斗中。之后，他们的级任导师“小香香”竟然也回到了过去……现代的少年们，被夕阳光芒照耀着的〈通往异世界之门〉给吸了进去，他们抵达的地方是…〈伊贺忍者〉和〈风魔忍者〉搏命相战的江户时代战场！这些少年被卷入了纷争之中，遇到了风魔忍者里的少女・风祭阳子…越过时空的邂逅，让他们的命运大为改变――现代的少年们，被夕阳光芒照耀着的〈通往异世界之门〉给吸了进去，他们抵达的地方是…〈伊贺忍者〉和〈风魔忍者〉搏命相战的江户时代战场！这些少年被卷入了纷争之中，遇到了风魔忍者里的少女‧风祭阳子…越过时空的邂逅，让他们的命运大为改变